Le territoire de la commune est partiellement inondable, en cas de crue du Lez. Des digues protègent les parties de la commune proche du Lez et de la Mosson, mais ne sont pas assez solides : un rapport de l’Inspection générale de l’environnement le signale et évalue le risque à trois cent morts à Lattes-Centre et certains lieux-dits comme les Marestelles, tout en jugeant les aménagements insuffisants.
Sur la rive gauche du Lez se trouve la plus grande partie des habitants et des activités de la commune. Les quartiers de Lattes-Centre et de Boirargues sont séparés par quelques exploitations agricoles, des champs inusités et des zones commerciales d'importance sur les axes de deux routes allant de Carnon à
Au sud de Lattes-Centre, l'étang du Méjean est une réserve naturelle protégée où les
oiseaux peuvent être observés. Une maison de la nature située à l'entrée permet de découvrir cet espace.
Sur la rive droite du Lez (rive gauche de la Mosson), se trouvent la ville de Maurin, quartier fondé au départ par des agriculteurs rapatriés d'Algérie et des habitants de Montpellier dans les années 1960, et deux quartiers isolés d'habitat peu dense : la Céreirède et les Marestelles. Le reste du territoire est constitué de champs agricoles ou d'herbes sèches ; la plupart des vignes ayant été arrachées. Au nord-est, à la limite avec Saint-Jean-de-Védas, l'écart (hameau) de la Jasse de Maurin borde le bois de Maurin dont il est séparé par la voie ferrée. Dans le bois de Maurin se trouve le point culminant naturel de la commune à 26 mètres d'altitude
2.
C'est sur la rive droite que se trouvent deux équipements gênants de l'agglomération de Montpellier, actuellement gérés par la
Communauté d'agglomération : la
station d'épuration de la Céreirède et la décharge du Thôt, près de l'étang de l'Arnel, fermée en 2008.
La réalisation d'un déversoir et l'aménagement du lit de la Lironde devrait éradiquer le risque d'inondation sur les rives du Lez.(Travaux achevés en 2009).(FG)Dans les années 1960, un groupe de rapatriés après la guerre d'Algérie et de Montpelliérains achète une grande partie du domaine de Maurin et s'entend avec la mairie de Lattes pour développer des activités horticoles dans la plaine viticole. Le domaine lui-même accueille la Société d'aménagement foncier et d'établissement rural (SAFER). Le
Crédit agricole du Midi y installe son siège social à côté d'une zone artisanale et du village de Maurin où s'installent une association de propriétaires montpelliérains désireux de s'installer là.
Lattes profite du développement de l'agglomération de
Montpellier. Alors que la commune, sans véritable centre, n'est constitué que de quelques maisons éparpillées sur son territoire, jusqu'au début des années 1960, elle atteint 15 000 habitants à la fin des années 1990.
Cependant, la quasi-totalité des lotissements récents de Lattes-Centre sont construits dans le lit majeur du Lez, lui-même enfermé dans de profondes digues. Le village de Maurin a été menacé par deux ruptures de digue sur la Mosson au cours desinondations exceptionnelles de 2002 et 2003 causées par des orages cévenols. Si le Lez, résurgence située à environ 30 km au nord de la commune, n'a pas inondé la plaine lattoise ces années-là, se pose néanmoins le problème des inondations, comme dans de nombreuses communes au pied des Cévennes.
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