Son nom est Sant-Joan-de-Vedats en occitan.
Située au sud-ouest de Montpellier, la commune est constituée d'un ensemble de collines de plus en plus pentues vers le sud-ouest et le massif de la Gardiole. Elle est traversée par le Rieucoulon le long de sa limite avec Montpellier, et par la rivière Mosson à l'ouest et au sud. Elle est limitrophe de Montpellier au nord et à l'est, de Lattes au sud-est, de Villeneuve-lès-Maguelone au sud, de Fabrègues et Lavérune à l'ouest.
La confluence des anciennes routes nationales RN112 (Montpellier-Sète déclassée en RD612) et RN113 (Montpellier-Béziers déclassée en RD613) et la présence de la barrière de péage sur l'
autoroute A9 font de la commune une des entrées principales de Montpellier. L'échangeur no 32 sur l'autoroute A9 met les grandes métropoles à proximité : Toulouse à 250 km, Marseille à 180 km, Lyon à 300 km et Barcelone à 350 km.
La zone urbanisée comprend :
le vieux village sur une des collines,
des extensions et de nouveaux lotissements qui ceinturent le vieux village,
au sud de la voie ferrée désaffectée, le quartier de villas de Saint-Jean-le-Sec.
Plus près de Montpellier, sur la route de
Sète, à l'est de l'échangeur autoroutier, se trouvent plusieurs zones commerciales et industrielles :
la zone commerciale est centrée sur un hypermarché Carrefour de taille réduite comparée à celles des autres enseignes au nord et au sud-est de Montpellier,
le journal
Midi libre a installé son siège social et ses imprimeries dans une zone proche (Mas de Grille),
la zone industrielle de La Lauze est installée plus au sud, sur d'anciennes
La commune possède encore des hectares de zones agricoles, principalement plantées en vignes (environ 300 hectares).
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